江戸時代。貧しい人々のための医療機関である「小石川養生所」。所長の新出去定（船越英一郎）は、恐れを、あるいは親しみを込めて「赤ひげ」と呼ばれていた。保本（中村蒼）、津川（前田公輝）、そして新人の田山（鈴木康介）ら医師が日々奮闘する養生所に、足を怪我（けが）した岡場所の遊女・およね（佐津川愛美）が入所してくる。ひねくれた性格のおよねは、やがて、どうやら赤ひげに恨みを抱いていることが分かり…。

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