桜田門外の変、外国船砲撃と続く時代のうねりの中で、蔵六は長州に戻ります。池田屋の変で新撰組の襲撃を受け、報復で京へ攻め上った長州藩。しかし、蛤（はまぐり）御門の変で敗北、下関戦争にも完敗し、心ならずも朝敵として長州征討の勅命が下ります。危機に陥った長州に俗論派が台頭する中で、高杉晋作が挙兵し倒幕派に統一。やがて桂小五郎も潜伏先から戻り、蔵六は幕府との戦いに備えて民兵組織を作ります。

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